《新世紀福音戰士》電影版第1部。分為“DEATH篇（死亡篇）”與“REBIRTH篇（新生篇）”兩個部分。“死亡篇”以原TV版動畫第1集到第24集的內容為基礎，重新剪輯了一個總結篇。“新生篇”內容承接第24集內容：第十七使徒被消滅后，SEELE向NERV下達命令，要EVA初號機負責執行“人類補完計劃”。然而碇元度不認同SEELE的做法，拒絕執行。SEELE認定這是一種叛變的行為，決定把NERV徹底消滅。破曉時分，NERV本部突然遭到來自戰略自衛隊的襲擊，他們對NERV的人員進行了慘無人道的大屠殺。為了保護駕駛員，葛城美里命令把精神崩潰的明日香送上二號機，并放在湖底的深處，自已就親自去救碇真嗣。但此時的碇真嗣已經處在精神崩潰的邊緣。