《穿過憂傷的花季》故事以貧瘠的山村和普通的鄉鎮中學為背景，講述了一群花季少年留守鄉村的故事。主人公星兒的父母到城里打工，她和奶奶在家相依為命。星兒的自行車丟了，她的同學陳軍每天騎車載她上學，從此星兒不遲到了，兩人的友情也變得深厚了。星兒的奶奶夜里突然生病，在陳軍和同學們的幫助下，將奶奶送到醫院。奶奶大病之后，請星兒的同學吃飯，卻無意中發現星兒的同學向華萍懷孕了。向華萍和爺爺留守在家，爺爺重男輕女，對孫女的學業、成長都不很在意。華萍的朋友羅大勇是學校的小混混，一天晚上兩人喝醉酒，犯了不該犯的錯誤。向華萍的媽媽只好帶向華萍離開村莊，進城打工。星兒奶奶突發意外去世，星兒不得不離開學校和家鄉，隨父母進城去了。